品系基本信息
特性和用途
多基因片段快速拼接克隆试剂盒
产品组成:
组成 | 货号 | VK009-10T | VK009-30T | |
Easy Assembly Mix(Mix) | Easy assembly 酶与反应 buffer 混合物;7.5μL/管 | VK009-1 | 10 管 | 30 管 |
Positive control(PC) | 阳性连接 DNA 片段和载体混合物(10μL) | VK009-2 |
注意:收到试剂盒后,使用前请离心,避免液体滞留在离心管盖、管壁上。
保存条件:-80℃ 保存一年;或 -20℃ 保存两个月。请将产品于 -80℃ 保存,避免反复冻融。
Easy Assembly反应示意图:
Easy Assembly 通过体外重组方法一步完成多个(2-6 个) DNA 片段无缝拼接连接(见下图)。Easy Assembly 是一种新颖的分子克隆方法,不需要传统克隆方式的酶切连接,仅需要 15-70bp(建议 50bp)的同源接头,并可以随意修改接头部位的序列,使得 DNA 克隆方便
快捷,连接更加精确,且反应时间短。
Easy Assembly 的优势:
1/ 实现多个 DNA 片段同时拼接
2/ 拼接 DNA 片段大小范围宽(260bp-10Kbp),实现大片段 DNA 的克隆
3/ 试验操作简单,避免了 DNA 酶切、回收、连接等分子克隆操作,操作时间大大缩短,约半小时可完成反应
4/ 反应效率高
适用范围:
1/ 载体≤15k; 连接片段长度 260bp-10Kbp; 连接 DNA 片段数目≤10
2/ 接头长度:15-70bp, 40-50bp 最佳
3/ DNA 片段推荐浓度:0.002-0.010pmol/片段
4/ 浓度计算:pmol=DNA 质量(ng)×1000/(碱基对数目×650D)。例如,50ng 5kb 的双链 DNA 为 0.015pmol
实验步骤:
1/ 分别通过 PCR 或者酶切准备进行拼接的 DNA 片段,定量。
2/ 取一支 easy Assembly mix 离心,避免液体残余管盖、管壁上,放置在冰上。
3/ 将各个 DNA 片段按等摩尔量混合,取总量 2.5μl 的 DNA 片段,加入到一支 easy Assembly mix 管中,混匀。
4/ 立即置于 50℃(可在 PCR 仪上进行),反应 30min-60min 后,然后进行 DNA 的 E.coli 转化,复苏,涂板。
注意事项:
1/ 加入的 DNA 片段应为等摩尔量。
2/ 加样过程于 4℃ 操作。
3/ 当出现下列情况建议使用 2 倍反应体系:连接 DNA 片段多于 5 段,或者单片段长度大于 6k, 接头长度小于 15bp 或大于 50bp, 反应片段摩尔量低于 0.0002pmol.
4/ 若接头大于 70bp, 建议适当延长反应时间。
5/ 多片段反应时,接头应避免出现重复序列,或者拼接片段中除接头外尽量不要再有接头序列,由于反应原理是体外同源重组,将可能出现这些同源序列的意外拼接。
6/ 建议使用 DH5α 感受态细胞进行转化。
7/ 建议转化后复苏 45min-1h.
同源接头设计例子:
下面序列是需要拼接的相邻 DNA 序列,分别用红色字体与黑色字体标示。所以接头的同源序列就直接取红色与黑色字体的交接处的 DNA 序列:
GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCACTCTGTGGCACTTTCCAATTTCAGACTCTGATCCGGACACT
CTTACAGGGNNNNNNNATGCTGGAGAAGTTCTGCAACTCTACTTTTTGGAATTCCTCATTCCTGGACAGTCCGGAGGCAGACCTGCCACTTTGTTTT
GAGCAAACTGTTCTGGTGTGGATTCCCTTGGGCTTCCTATGGCTCCTGGCCCCCTGGCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTC
TACCACCAAACTCTATCTTGCTAAGCAGGTATTCGTTGGTTTTCTTCTTATTCTAGCAGCCATAGAGCTGGCCCTTGTACTCACAGAAGACTCTGGAC
AAGCCACAGTCCCTGCTGTTCGANNNNNNNNNNTGATCTTTTCAGCATTTTCAGAAAATAATGAGT
CATCAAATAATCCATCA
因此,接头同源序列可以加在引物上,如下:
片段 1 正向引物:根据上一段拼接的序列而定
片段 1 反向引物:
TGGTGGTAGAGGATCTCTTGGTCCTGGATTTATACACGTGGAGAAGCTGC
片段 2 正向引物:
GCAGCTTCTCCACGTGTATAAATCCAGGACCAAGAGATCCTCTACCACCA
片段 2 反向引物:根据下一段拼接的序列而定
片段 1 和片段 2 的 PCR 产物,再加上其他 DNA 片段将可以通过 Easy Assembly Cloning Kit 无缝拼接在一起了。
验证数据
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